Veštačka inteligencija predviđa strukturu skoro svakog proteina

Veštačka inteligencija predviđa strukturu skoro svakog proteina

Započeta je nova era bioloških istraživanja, sa veštačkom inteligencijom (AI) koja predviđa 3D oblik skoro svakog proteina poznatog nauci, i to samo godinu dana nakon prvog objavljivanja podataka.

Zahvaljujući „AlphaFold“, alatu koji je razvila kompanija za veštačku inteligenciju u vlasništvu „DeepMind“, više od 200 miliona proteinskih struktura je sada podeljeno u bazi podataka koja se može besplatno pristupiti, pod nazivom „AlphaFold DB“, piše Science alert.

Ovo dostignuće utire put neopisivim putevima naučnog istraživanja proteina, građevnih blokova života. A istraživači se vrte u glavi od uzbuđenja.

„Određivanje 3D strukture proteina nekada je trajalo mnogo meseci ili godina, a sada su potrebne sekunde“, objasnio je kardiolog Erik Topol iz „Scripps Research Translational Institute“ u izjavi o objavljivanju podataka.

On smatra da sa ovim novim dodatkom, možemo očekivati da će se više bioloških misterija rešavati svakog dana.

U saradnji sa naučnicima Evropskog instituta za bioinformatiku (EMBL-EBI) Evropske laboratorije za molekularnu biologiju, „DeepMind“ je u julu prošle godine predstavio svoju prvu seriju „AlphaFold“ predviđanja.

Najavljen kao revolucionarni alat koji će transformisati biološka istraživanja i ubrzati otkrivanje lekova, „AlphaFold“ predviđa 3D oblik proteina na osnovu njihovih sekvenci aminokiselina.

Povezane zajedno u lance, ove sekvence aminokiselina spajaju dugačke proteine koji su presavijeni u nabrane listove i uvrnute trake.

Razumevanjem oblika u koji se savija bilo koji protein, naučnici mogu da shvate kako taj protein funkcioniše, dešifrujući njegovu glavnu uloga unutar ćelija.

„AlphaFold“ je dizajniran da ubrza taj proces, obezbeđujući u ovom najnovijem izdanju podataka više od 200 miliona predviđenih struktura proteina pronađenih u biljkama, bakterijama, životinjama i drugim organizmima.

„Ta nada je postala stvarnost mnogo brže nego što smo se usudili da sanjamo“, rekao je izvršni direktor „DeepMind“ Demis Hasabis u izjavi o najnovijim podacima.

Istraživači su već koristili prvu grupu predviđanja „AlphaFold“ da usavrše svoje razumevanje smrtonosnih bolesti kao što je malarija, da bi otvorili vrata poboljšanim vakcinama i da dešifruju biološke zagonetke o behemotskim proteinima koje su decenijama zbunjivale naučnike.