Veštačka inteligencija predviđa strukturu skoro svakog proteina
Započeta je nova era bioloških istraživanja, sa veštačkom inteligencijom (AI) koja predviđa 3D oblik skoro svakog proteina poznatog nauci, i to samo godinu dana nakon prvog objavljivanja podataka.
Zahvaljujući „AlphaFold“, alatu koji je razvila kompanija za veštačku inteligenciju u vlasništvu „DeepMind“, više od 200 miliona proteinskih struktura je sada podeljeno u bazi podataka koja se može besplatno pristupiti, pod nazivom „AlphaFold DB“, piše Science alert.
Ovo dostignuće utire put neopisivim putevima naučnog istraživanja proteina, građevnih blokova života. A istraživači se vrte u glavi od uzbuđenja.
„Određivanje 3D strukture proteina nekada je trajalo mnogo meseci ili godina, a sada su potrebne sekunde“, objasnio je kardiolog Erik Topol iz „Scripps Research Translational Institute“ u izjavi o objavljivanju podataka.
On smatra da sa ovim novim dodatkom, možemo očekivati da će se više bioloških misterija rešavati svakog dana.
U saradnji sa naučnicima Evropskog instituta za bioinformatiku (EMBL-EBI) Evropske laboratorije za molekularnu biologiju, „DeepMind“ je u julu prošle godine predstavio svoju prvu seriju „AlphaFold“ predviđanja.
Najavljen kao revolucionarni alat koji će transformisati biološka istraživanja i ubrzati otkrivanje lekova, „AlphaFold“ predviđa 3D oblik proteina na osnovu njihovih sekvenci aminokiselina.
Povezane zajedno u lance, ove sekvence aminokiselina spajaju dugačke proteine koji su presavijeni u nabrane listove i uvrnute trake.
Razumevanjem oblika u koji se savija bilo koji protein, naučnici mogu da shvate kako taj protein funkcioniše, dešifrujući njegovu glavnu uloga unutar ćelija.
„AlphaFold“ je dizajniran da ubrza taj proces, obezbeđujući u ovom najnovijem izdanju podataka više od 200 miliona predviđenih struktura proteina pronađenih u biljkama, bakterijama, životinjama i drugim organizmima.
„Ta nada je postala stvarnost mnogo brže nego što smo se usudili da sanjamo“, rekao je izvršni direktor „DeepMind“ Demis Hasabis u izjavi o najnovijim podacima.
Istraživači su već koristili prvu grupu predviđanja „AlphaFold“ da usavrše svoje razumevanje smrtonosnih bolesti kao što je malarija, da bi otvorili vrata poboljšanim vakcinama i da dešifruju biološke zagonetke o behemotskim proteinima koje su decenijama zbunjivale naučnike.